病斑可发生在果面的任何部位，初期病斑圆形、淡褐色。病部不断扩展，迅速蔓延至全果，呈褐色水渍状，变软腐烂，有腐臭味，受害果实很快脱落，高温高湿时，病部表面生出稀疏的白色菌丝，即病原菌的子实体。在果园中，病菌为害柑橘主干基部，导致皮层腐烂，称“脚腐病”。
(1)农业措施：加强栽培管理，保持果园通透性良好；避免果园积水，平衡偏施肥；丰产果园，及时撑起下垂到地面的果实，避免土壤中的病菌经雨水击溅到枝叶和果实上，引起发病。冬季采果后，结合修剪清洁地面的枯枝残叶，集中烧毁，并喷杀菌剂。
(2)化学防治：每年9月上旬应预先喷杀菌剂，药剂可选择70％甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液，57.6%氢氧化铜干粒剂1000倍液，20％噻菌铜悬浮剂500倍液等，以保护柑橘果实。
病菌以菌丝体和厚垣孢子在病组织和土壤中越冬。次年气温升高，雨量增多时开始活动，孢子囊释放游动孢子，随雨水飞溅到近地面的果实上侵入为害，导致果实发病。水源充足的果园，灌溉水常起传播孢子的作用。发生涝害、果园低洼、排水不良、土壤黏重，可加重病情；气温高、闷热并暴雨或连续2、3天下雨即可发病；通透性差或特别丰产、果实披垂堆叠的植株和果园，原来脚腐病发生严重的果园，极易发生；偏施氮肥的果园发病重；地窖贮藏库发病重。9月中旬至10月是发病高峰期。
