柑橘喜土层深厚、有机质含量丰富、透气性良好的微酸性壤质土壤。当土壤条件不适宜时，则会有不同程度的损害根系，逐渐出现植株树冠叶片失去光泽，变黄，叶脉干枯并且呈黄色或金黄色等症状。
需要结合引起根系损伤的具体原因进行针对性防治，主要有：
(1)加强栽培管理，园区深挖排水沟，降低田间水位，雨后及时排除积水。
(2)增施有机质肥料，薄肥多施；施用化肥时少量多次，树冠滴水线下开长沟施用，避免肥料堆积。
(3)根据树龄适当定产，适度环割保果，适当疏果，保证树势壮旺，根系有足够营养。
(4)发现若是由于微生物导致根腐时(烂根可以闻到臭味)，可以用恶霉灵、敌克松、甲霜灵等杀菌剂灌根。
造成柑橘根系损伤的因素众多：1、管理不当。橘树挂果过多，糖和氨基酸类等光合产物营养多输送到幼果，根系缺乏营养。根系饿死继而腐烂，致使柑橘由青绿转而衰弱黄化，加剧烂根。一般毛细根、小根先腐烂。2、果园排水不畅。土壤板结或者土壤积水过多，造成根系缺氧沤烂。3、肥害药害。施用化肥过多，或局部积累过多，或施用未腐熟有机肥，或使用腐熟有机肥浓度过高，或除草剂施用过多等，引起肥害、药害造成烧根、烂根。4、环割过度。对弱树环割或环割过度，影响营养回流，造成根饥饿。5、过度修剪。对枝干进行重修剪，相对称的根系生长亦会受到影响。6、微生物致病。土壤中的疫霉菌、腐霉菌、镰孢菌、蜜环菌、杯伞菌、根串珠霉菌、多主瘤梗孢菌等易侵染根系，造成烂根。通常腐烂由树头附近的主根开始，根系纵向裂口腐烂，木质部变黑。7、根结线虫为害。8、虫害为害。星天牛、一点蝙蛾等蛀干害虫为害，破坏木质部或韧皮部，造成营养输送受阻。根系缺营养而烂根，植株叶脉黄化，后期整株叶片变黄。毛细根、小根先腐烂。9、黄龙病危害。柑桔黄龙病病原在韧皮部筛管细胞里繁殖，病原在枝梢韧皮部大量繁殖，继而堵塞筛管。植株向下运输养分功能降低，光合产物到达根系量少，根系饥饿，后期根系会大量死亡。根系腐烂后于植株叶片变黄。植株表现有均匀黄化、斑驳黄化、红鼻子果等症状。
