小麦锈病有秆锈、叶锈和条锈三种，条锈成行、叶锈乱、秆锈是个大红斑，锈病的孢子零散生于小麦的茎秆和叶片上，呈橘红色，孢子堆较大，最适宜温度为20℃。叶锈病的孢子堆分散或密集在小麦叶片上，呈红褐色，颜色比秆锈病淡，孢子堆也比秆锈病小，对温度的要求介于秆锈和条锈之间，条锈病的孢子堆在小麦穗部和叶片上沿叶脉排列成显著的条斑，颜色为黄色以至枯黄色，子堆比叶锈病小、气温在5-15℃时最适宜发育，气温低于0℃时发育受阻，有间歇的小雨和雾露天气可助长发育。
(1)小麦品种的抗病性只是相对的。在当地比较抗病的小麦品种，种植数年以后，不易感病的锈病生理品种逐步退位，而易感病的锈病生理品种逐步产生，发生面积逐步扩大，为害加重，使小麦抗病性丧失，成为感病品种。
(2)铲除杂草，施足底肥，早施追肥，增施钾肥，在分蘖到拔节期追施草木灰、钾肥，在拔节到抽穗期喷施磷肥，增加植株抗病能力。
(3)药剂拌种是控制菌量的重要手段，拌种可用60克/升戊唑醇悬浮种衣剂，或3％苯醚甲环唑悬浮种衣剂进行种子处理，或用15％三唑酮可湿性粉剂150g拌种100kg。拌种时要严格用药剂量，力求均匀，拌过的种子应当日播完，避免药害。
(4)防治小麦锈病的药剂比较多，目前应用较广的药剂是三唑酮，建议使用新型三唑类杀菌剂如用12.5％氟环唑悬浮剂每亩20～30g，或25％丙环唑乳油，每亩30~40g，或300克/升苯甲·丙环唑乳油每亩20g，或25％戊唑醇悬浮剂每亩30g，或亩用15％三唑酮可湿性粉剂80g，或12.5％烯唑醇可湿性粉剂40g。新型三唑类杀菌剂持效期更长、安全性更好。
锈病病菌寄生在小麦上，吸取寄主的营养才可生存，其寄生性较强。不同锈病的种群对同一种小麦的寄生反应是不一样的，有的可在其上寄生，有的却不适宜寄生，即病菌有生理分化现象，人们把不同的病菌种群为不同的生理品种。若当地主要种植的小麦品种不适宜当地的病菌寄生，即小麦对锈病产生抗性，可以抵制其发生流行。所以，品种的抗性是影响小麦锈病流行的一个主要因素。环境条件(主要是田间气候)是影响小麦锈病为害流行的第二位因素，春季气温高、雨多、田间温差大，有利于锈病的侵染为害，反之，锈病不易发生。
